Dr. Claus Hultschig

Angestellt, Bioinformatician, Universitätsspital Basel

Basel, Schweiz

Fähigkeiten und Kenntnisse

Next Generation Sequencing
Python-Programmierung
R

Werdegang

Berufserfahrung von Claus Hultschig

  • Bis heute 7 Jahre, seit Juni 2017

    Bioinformatician

    Universitätsspital Basel

    Key responsibilities: *Analyzing next generation sequencing data. *Determination of mutations indicative for Malignant Hyperthermia. *Establishing an analysis pipeline for the identification of mutations in patient sample ­data. * Experimental design Major achievements: * Identification a set of new point mutations indicative for Malignat Hyperthermia. * Establishing end to end analysis pipelines for the determination of indication specific SNP starting with NGS fastq files.

  • 1 Jahr und 4 Monate, Nov. 2015 - Feb. 2017

    Research Associate

    sciCORE, Center for Scientific Computing, Basel University, Switzerland

    Key responsibilities: * Analyzing next generation sequencing data (RNA-Seq). * Data analysis using R, Linux programs and command line tools on the sciCORE High Performance Computing Cluster. * Development of Python programs for data extraction, conversion and analysis. * Developing new bio-informatic methods Major achievements: * Identification of methods for estimation of RNA degradation using RNA-Seq data. * Programming new bioinformatic routines for estimating RNA degradation.

  • 4 Jahre und 10 Monate, Jan. 2011 - Okt. 2015

    Freelancer & Consultant

    Freelancer

    Design of laboratory automation procedures. Identification and evaluation of new technologies. Data analysis.

  • 1 Jahr und 1 Monat, Sep. 2009 - Sep. 2010

    Senior Lead Scientist & Window-Person

    Eidgenössische Technische Hochschule Dept of Biosystems Science & Engineering

    Identifying high throughput technology platforms producing relevant data for consortium-wide high-impact publications In close collaboration with the lead scientist of each technology platform, defining the acceptable numeric ranges and formats of data to be uploaded to a database system Translating scientific needs into specifications of data processing routines Supporting scientists in the use of the developed database Reporting the progress of the database implementation to the European community

  • 2 Jahre und 4 Monate, Feb. 2007 - Mai 2009

    Leiter Microarray NovaChip Print Labor und Automationsexperte

    Novartis Pharma AG

    Aufgaben: * Verbesserung, Organisation und Betrieb des Microarray Print Laboratoriums. * Ausarbeitung von Standard Operating Procedures. * Entwurf, Überwachung und Teilnahme an einer Evaluierungsstudie über die Eignung des NovaChips für diagnostische Fragestellungen. Haupterfolge: * Optimierung der Protokolle zur Microarray Herstellung und Verwendung. Gewährleistung des fristgerechten und erfolgreichen Abschlusses der NovaChip Evaluierung.

  • 6 Jahre und 4 Monate, Okt. 2000 - Jan. 2007

    Group leader of the Automation group

    Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin

Ausbildung von Claus Hultschig

  • 5 Jahre und 9 Monate, Mai 1995 - Jan. 2001

    Biochemie, Molekularbiologie

    Technische Universität Braunschweig / Gesellschaft für Biotechnologische Forschu

    Peptid Arraytechnologie, Phagedisplay, Biacore, molekulare Wechselwirkungen,

  • 4 Jahre, Okt. 1990 - Sep. 1994

    Chemie

    Universität Konstanz

    Chemie Hauptstudium an der Universität Konstanz mit Diplomarbeit in der Arbeitgruppe für bioorganische Chemie, Fakultät für Biologie, Universität Konstanz unter der Anleitung von Prof. Dr. S. Ghisla.Abschluss: Diplom-Chemiker.

  • 1 Jahr und 1 Monat, Sep. 1989 - Sep. 1990

    Environmental Sciences

    Rutgers State University of New Jersey, New Brunswick, NJ, USA

    Hauptstudium der Umweltwissenschaften

  • 1 Jahr und 11 Monate, Okt. 1987 - Aug. 1989

    Chemie

    Universität Konstanz

    Chemie Grundstudium

Sprachen

  • Deutsch

    Muttersprache

  • Englisch

    Fließend

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