Dr. Claus Hultschig
Angestellt, Bioinformatician, Universitätsspital Basel
Basel, Schweiz
Werdegang
Berufserfahrung von Claus Hultschig
Key responsibilities: *Analyzing next generation sequencing data. *Determination of mutations indicative for Malignant Hyperthermia. *Establishing an analysis pipeline for the identification of mutations in patient sample data. * Experimental design Major achievements: * Identification a set of new point mutations indicative for Malignat Hyperthermia. * Establishing end to end analysis pipelines for the determination of indication specific SNP starting with NGS fastq files.
1 Jahr und 4 Monate, Nov. 2015 - Feb. 2017
Research Associate
sciCORE, Center for Scientific Computing, Basel University, Switzerland
Key responsibilities: * Analyzing next generation sequencing data (RNA-Seq). * Data analysis using R, Linux programs and command line tools on the sciCORE High Performance Computing Cluster. * Development of Python programs for data extraction, conversion and analysis. * Developing new bio-informatic methods Major achievements: * Identification of methods for estimation of RNA degradation using RNA-Seq data. * Programming new bioinformatic routines for estimating RNA degradation.
4 Jahre und 10 Monate, Jan. 2011 - Okt. 2015
Freelancer & Consultant
Freelancer
Design of laboratory automation procedures. Identification and evaluation of new technologies. Data analysis.
1 Jahr und 1 Monat, Sep. 2009 - Sep. 2010
Senior Lead Scientist & Window-Person
Eidgenössische Technische Hochschule Dept of Biosystems Science & Engineering
Identifying high throughput technology platforms producing relevant data for consortium-wide high-impact publications In close collaboration with the lead scientist of each technology platform, defining the acceptable numeric ranges and formats of data to be uploaded to a database system Translating scientific needs into specifications of data processing routines Supporting scientists in the use of the developed database Reporting the progress of the database implementation to the European community
2 Jahre und 4 Monate, Feb. 2007 - Mai 2009
Leiter Microarray NovaChip Print Labor und Automationsexperte
Novartis Pharma AG
Aufgaben: * Verbesserung, Organisation und Betrieb des Microarray Print Laboratoriums. * Ausarbeitung von Standard Operating Procedures. * Entwurf, Überwachung und Teilnahme an einer Evaluierungsstudie über die Eignung des NovaChips für diagnostische Fragestellungen. Haupterfolge: * Optimierung der Protokolle zur Microarray Herstellung und Verwendung. Gewährleistung des fristgerechten und erfolgreichen Abschlusses der NovaChip Evaluierung.
6 Jahre und 4 Monate, Okt. 2000 - Jan. 2007
Group leader of the Automation group
Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin
Ausbildung von Claus Hultschig
5 Jahre und 9 Monate, Mai 1995 - Jan. 2001
Biochemie, Molekularbiologie
Technische Universität Braunschweig / Gesellschaft für Biotechnologische Forschu
Peptid Arraytechnologie, Phagedisplay, Biacore, molekulare Wechselwirkungen,
4 Jahre, Okt. 1990 - Sep. 1994
Chemie
Universität Konstanz
Chemie Hauptstudium an der Universität Konstanz mit Diplomarbeit in der Arbeitgruppe für bioorganische Chemie, Fakultät für Biologie, Universität Konstanz unter der Anleitung von Prof. Dr. S. Ghisla.Abschluss: Diplom-Chemiker.
1 Jahr und 1 Monat, Sep. 1989 - Sep. 1990
Environmental Sciences
Rutgers State University of New Jersey, New Brunswick, NJ, USA
Hauptstudium der Umweltwissenschaften
1 Jahr und 11 Monate, Okt. 1987 - Aug. 1989
Chemie
Universität Konstanz
Chemie Grundstudium
Sprachen
Deutsch
Muttersprache
Englisch
Fließend